sample, nclusters, ngenes, sample_title, temperature, salinity, country, location, depth, collection_date, project_name, environment_feature, environment_material, biome
ERR6857195, 1748, 61558, "Permafrost - BGG_BOSW", --, --, "Russia", 68.370155 N 161.415553 E, --, 2012-08-08, cryosoil metagenomes, Yedoma, "soil", Land.Soil
ERR2639422, 1305, 50344, "Fenway inactive solid surface 1", --, --, "Pacific Ocean", 3.7285167 S 151.6724833 E, --, 2011-06-14/2011-07-23, Manus Basin inactive chimneys, marine hydrothermal vent, "mineral", Ocean.Extreme env.
ERR1879358, 1142, 64057, "TG1.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879357, 1108, 60038, "TG1.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879331, 1086, 54532, "STM5.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879356, 1066, 57464, "TG1.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879349, 1043, 52501, "TG25.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879348, 1022, 52904, "TG25.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879362, 1004, 55283, "TG25.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879330, 985, 51812, "STM5.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879377, 950, 56085, "SPM5.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879374, 917, 56599, "SPM1.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879343, 896, 49348, "STM5.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1981057, 895, 43748, "Southampton AD metagenomics", --, --, "United Kingdom", 50.9339 N 1.4107 W, --, 2016-01-22, H2AD metagenomics, organic, "sludge", Engineered.Solid Waste
ERR1879372, 861, 57463, "SPM1.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879375, 849, 54719, "SPM5.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879380, 840, 48431, "SPM25.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879376, 824, 51574, "SPM5.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879373, 821, 54869, "SPM1.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879364, 820, 51369, "TG5.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879363, 755, 46359, "TG5.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879378, 742, 47496, "SPM25.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR2639423, 735, 39372, "Satanic Mills inactive solid surface 2", --, --, "Pacific Ocean", 3.7269 S 151.6720167 E, --, 2011-06-14/2011-07-23, Manus Basin inactive chimneys, marine hydrothermal vent, "mineral", Ocean.Extreme env.
ERR3534967, 698, 32346, "S13_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR1879379, 675, 42858, "SPM25.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879365, 661, 43517, "TG5.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879329, 651, 45493, "STM1.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879328, 645, 44389, "STM1.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR3534969, 637, 26146, "S15_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR1879298, 588, 38377, "blank3.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1739697, 561, 26498, "artificial minimal coastal microbial mats", --, --, "Netherlands", 53.489606 N 6.139913 E, 0.01, 2015-11, Minimal Mat 1, Beach, "soil", Land.Soil
ERR712371, 560, 48491, "Aalborg West Q5 2010 A", --, --, "Denmark", 57.04951 N 9.864788 E, --, 2010-12-12, Metagenomes of Danish EBPR WWTPs, wastewater treatment plant, "activated sludge", Engineered.Wastewater
ERR2639424, 551, 36604, "Solwara 8 inactive chimney surface 1", --, --, "Pacific Ocean", 3.730529 S 151.674185 E, --, 2011-06-14/2011-07-23, Manus Basin inactive chimneys, marine hydrothermal vent, "mineral", Ocean.Extreme env.
ERR1879360, 546, 30717, "TG10.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879300, 545, 35920, "blank3.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879299, 543, 43913, "blank3.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR3534965, 543, 30081, "S11_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR3679662, 535, 18421, "MEM010", --, --, "---", ---, --, ---, Hospital Microbiome, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR1879359, 534, 27476, "TG10.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879297, 528, 36271, "blank2.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1981049, 521, 36569, "Naburn AD metagenomics", --, --, "United Kingdom", 53.96 N 1.0873 W, --, 2016-01-07, H2AD metagenomics, organic, "sludge", Engineered.Solid Waste
ERR1879296, 512, 36903, "blank2.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1981053, 511, 37431, "Sheffield AD metagenomics", --, --, "United Kingdom", 53.3811 N 1.4701 W, --, 2016-01-14, H2AD metagenomics, organic, "sludge", Engineered.Solid Waste
ERR1879333, 507, 41370, "STM25.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879295, 505, 37904, "blank2.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879342, 503, 36560, "STM1.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR2834528, 497, 38152, "V16_c.mid", --, --, "Greece", 36.52 N 25.48 E, --, 2013-09, V16_c Chimney Metagenome Study, marine hydrothermal vent chimney, "biofilm material", Ocean.Extreme env.
ERR1879361, 495, 27312, "TG10.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
DRR046817, 488, 34614, "Sewage activated sludge", --, --, "Japan:Tokyo, Hachioji", 35.6693 N 139.4257 E, --, 2014, activated sludge metagenome, bioreactor, "activated sludge", Engineered.Wastewater
ERR4352705, 463, 9856, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR4352706, 462, 12530, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR1879303, 461, 42713, "blank4.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR2210127, 450, 27690, "Fraction 9", --, --, "USA", 42.67255 N 77.040283 W, --, 2011-10-21, Stable isotope probing with cellulose in agricultural soil., soil, "soil", Land.Soil
ERR4352701, 449, 8296, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR3534968, 443, 21979, "S14_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR4352702, 435, 9792, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR4352708, 430, 9054, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR4352707, 416, 11074, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR4352699, 412, 9616, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR4352700, 402, 8251, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR1901819, 401, 32439, "H2 and CH4", --, --, "China", 31.2 N 121.4 E, --, 2016-10-01, H2 and CH4, anaerobic, "sludge", Engineered.Solid Waste
ERR1879332, 395, 39976, "STM25.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR3534966, 391, 23153, "S12_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR1879301, 383, 33019, "blank4.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879302, 367, 30727, "blank4.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879309, 360, 35735, "blank6.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1726863, 353, 33587, "TARA_20120224T1140Z_148_EVENT_PUMP_P_S_(5 m)_PROT_NUC-DNA(100L)_W0.8->_TARA_N000002111", 20.4, --, "---", 31.6948 N 64.2489 W, 5, ---, AHX, surface water layer (ENVO:00002042), "particulate matter, including plankton (ENVO:xxxxxxxx)", Ocean.Pelagic
ERR1981059, 347, 22071, "Southampton AD metagenomics", --, --, "United Kingdom", 50.9339 N 1.4107 W, --, 2016-01-22, H2AD metagenomics, organic, "sludge", Engineered.Solid Waste
SRR5007147, 343, 40974, "Med-OCT2015-2000m", --, --, "Spain: off the coast of Alicante", 37.35361 N 0.286194 W, 2000m, 2015-10-15, marine metagenome, seawater, "seawater", Ocean.Pelagic
ERR3534977, 329, 13137, "S23_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR1879344, 327, 26427, "STM25.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1901826, 322, 25568, "H2 and CH4", --, --, "China", 31.2 N 121.4 E, --, 2016-10-01, H2 and CH4, anaerobic, "sludge", Engineered.Solid Waste
ERR868353, 320, 37364, "TARA_20100316T0614Z_038_Combined-EVENTS_CAST_MB_M_(340 m)_PROT_NUC-DNA(100L)_W0.8-5_TARA_N000000031", 15.0, --, "---", 19.0351 N 64.5638 E, 340, ---, AHX, mesopelagic zone (ENVO:00000213) & marine oxygen minimum zone (ENVO:01000065), "particulate matter, including plankton (ENVO:xxxxxxxx)", Ocean.Pelagic
ERR5863208, 317, 37667, "Freshwater metagenome from Zurich Lake, Switzerland 80m depth, 15may2019", --, --, "Switzerland", 47.3 N 8.566667 E, --, 2019-05-15, Freshwater Metagenomes from European Lakes and Reservoirs (including time-series metagenomes), fresh water, "---", Land.Freshwater
ERR712377, 315, 34718, "Aalborg West Q5 2010 C", --, --, "Denmark", 57.04951 N 9.864788 E, --, 2012-12-12, Metagenomes of Danish EBPR WWTPs, wastewater treatment plant, "activated sludge", Engineered.Wastewater
ERR1879354, 313, 25102, "TG0.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR3624096, 313, 30252, "3847_C", --, --, "Mediterranean Sea", 42.808304 N 10.142891 E, 7, 2016-04-11, ---, shallow marine sediment [ENVO:03000034], "sediment [ENVO:00002007]", Land.Freshwater
ERR1879355, 307, 25062, "TG0.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR688347, 307, 29773, "SEQld", --, --, "Australia", 26.640017 S 153.079977 E, 0.43, 2012-05-29, Metagenomic survey of SE Queensland estuaries, Maroochydoore River, "Sediment", Land.Freshwater
ERR3534971, 303, 15225, "S17_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR2834531, 302, 29525, "V16_c.in", --, --, "Greece", 36.52 N 25.48 E, --, 2013-09, V16_c Chimney Metagenome Study, marine hydrothermal vent chimney, "biofilm material", Ocean.Extreme env.
ERR3534962, 297, 12980, "S07_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR3839022, 277, 21613, "Bioelectrochemical systems (BES) exploit the interaction between microbes and electrodes. A field of application thereof, is bioelectrochemical remediation, an effective strategy in environments where the absence of suitable electron acceptors limits classic bioremediation approaches. Understanding the microbial community structure and genetic potential of anode biofilms is of great interest to interpret the mechanisms occurring in BES. In this study, by using a whole metagenome sequencing approach, taxonomic and functional diversity patterns in the inoculum and on the anodes of three continuous-flow BES for the removal of phenol, toluene and BTEX were obtained. The genus Geobacter was highly enriched on the anodes and two reconstructed genomes were taxonomically related to the Geobacteraceae family. To functionally characterize the microbial community, the genes coding for the anaerobic degradation of toluene, ethylbenzene and phenol were selected as genetic markers for the anaerobic degradation of the pollutants. The genes related with direct extracellular electron transfer (EET) were also analyzed. The inoculum carried the genetic baggage for the degradation of aromatics but lacked the capacity of EET, while anodic bacterial communities were able to pursuit both processes. The metagenomic approach provided useful insights into the ecology and complex functions within hydrocarbon degrading electrogenic biofilms.", --, --, "---", ---, --, 2016, Metagenomics of bioelectrochemical systems, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR868451, 271, 27657, "TARA_20120130T2219Z_144_Combined-EVENTS_CAST_MB_M_(390 m)_PROT_NUC-RNA(100L)_W0.8-3_TARA_N000003195", 17.9, --, "---", 36.4121 N 72.9289 W, 390, ---, AHX, mesopelagic zone (ENVO:00000213), "particulate matter, including plankton (ENVO:xxxxxxxx)", Ocean.Pelagic
ERR977414, 269, 18817, "Vetmed_23", --, --, "Austria", 48.254946 N 16.429344 E, --, 2015-01-21, Commamox metagenomes Illumina, wastewater treatment plant, "activated sludge", Engineered.Wastewater
ERR1742253, 265, 23703, "IX1314_D1T5TACXX_1_CGATGT", --, --, "Canada", 52.32 N 121.92 W, --, 2007-07-15, Forest harvesting reduces the soil metagenomic potential for biomass decomposition, forest, "soil", Land.Soil
ERR868365, 265, 28482, "TARA_20110615T1845Z_112_Combined-EVENTS_CAST_MB_M_(696 m)_PROT_NUC-RNA(100L)_W0.8-3_TARA_N000001846", 5.8, --, "---", 23.2232 S 129.5986 W, 696, ---, AHX, mesopelagic zone (ENVO:00000213), "particulate matter, including plankton (ENVO:xxxxxxxx)", Ocean.Pelagic
ERR4352703, 263, 5714, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR3534973, 262, 12538, "S19_Epibacterial", --, --, "---", ---, --, ---, Epibacterial communities of Agarophyton vermicullophylum varying salinity, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR4352704, 259, 4199, "2018-04-17_10μm", --, --, "North Sea", 54.19 N 7.9 E, --, 2018-04-17, ---, microbial feature [ENVO:00002150], "coastal sea water [ENVO:00002150]", Ocean.Pelagic
ERR1879307, 258, 34811, "blank6.1", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR1879308, 257, 33415, "blank6.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
SRR4453772, 251, 33282, "MIMS Environmental/Metagenome sample from hydrothermal vent metagenome", --, --, "Tonga: Lau Basin", 21.9892 S 176.5677 W, 1876 m, 2005-05-21, hydrothermal vent metagenome, hydrothermal vent, "rock", Ocean.Extreme env.
SRR1699482, 249, 27812, "MIMS Environmental/Metagenome sample from marine metagenome", --, --, "USA: Coal Oil Point, Santa Barbara, California", 34.39192 N 119.84578 W, 47 m, 2009-06, marine metagenome, Water, "Oil polluted marine water", Ocean.Pelagic
ERR1879306, 248, 30019, "blank5.3", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater
ERR2234939, 248, 20406, "Compost on farm", --, --, "Italy", 40.554724 N 14.95912 E, --, 2016, Compost_onfarm, Agricultural environmental material, "Compost", Engineered.Solid Waste
ERR2431947, 246, 30137, "Marine sediment microbiome", --, --, "Arctic Ocean", 70.66000000000001 N 135.95416666666668 W, --, 2014-03-18, Marine sediment microbiome, sea, "soil", Land.Freshwater
SRR747868, 246, 21142, "Integrated metagenomic and physiochemical analyses to evaluate the potential role of microbes in the sand filter of a drinking water treatment system", --, --, "---", ---, --, ---, biofilter metagenome, ---, "---", Engineered.Surfaces
ERR977415, 244, 17860, "Vetmed_23", --, --, "Austria", 48.254946 N 16.429344 E, --, 2015-01-21, Commamox metagenomes Illumina, wastewater treatment plant, "activated sludge", Engineered.Wastewater
ERR1879305, 242, 28901, "blank5.2", --, --, "China", 116.3 N 39.9 E, --, 2016-04, ---, ---, "---", Engineered.Wastewater